Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST3Q8N1M1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST3Q8N1M1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST3Q8N1M1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BEST3Q8N1M1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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