Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNMB4Q86W47 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms