Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms