Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SNX20Q7Z614 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX20Q7Z614 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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