Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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