Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED9Q6R2W3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
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