Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms