Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms