Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CATSPEREQ5SY80 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CATSPEREQ5SY80 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CATSPEREQ5SY80 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms