Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms