Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDLIM3Q53GG5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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