Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms