Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms