Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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