Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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