Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms