Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms