Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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