Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ALCAMQ13740 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms