Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF5Q13568 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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