Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TUBB3Q13509 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB3Q13509 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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