Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms