Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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