Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms