Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms