Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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