Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLFN5Q08AF3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms