Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms