Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC18A2Q05940 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms