Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPN12Q05209 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN12Q05209 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms