Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLOD1Q02809 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms