Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms