Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFITM3Q01628 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms