Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-24P63145 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms