Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms