Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ACTBP60709 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACTBP60709 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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