Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms