Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF10P55107 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDF10P55107 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms