Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMSP52788 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMSP52788 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMSP52788 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMSP52788 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMSP52788 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMSP52788 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMSP52788 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMSP52788 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMSP52788 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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