Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP5P51878 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP5P51878 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms