Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CRIP1P50238 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms