Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRCC3P46736 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRCC3P46736 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms