Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSBP45954 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms