Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAGEA4P43358 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms