Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK1P39086 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms