Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCAP28676 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCAP28676 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCAP28676 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms