Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTX3P26022 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTX3P26022 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTX3P26022 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms