Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NFKBIAP25963 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms