Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHCEP18577 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHCEP18577 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHCEP18577 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms