Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GM2AP17900 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GM2AP17900 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GM2AP17900 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms